Da diese Frage hier immer wieder auftaucht, habe ich das Thema hier nun angepinnt!
Wer Probleme hat, seine große SD-Karte nach FAT32 zu formatieren, kann das unter Windows mit dem Tool SAK von Kempa machen: https://github.com/dezem/SAK/releases oder direkt mit guiformat.zip Dort sollte die Zuordnungseinheit auf 32768 eingestellt sein. Eine Formatierung der SD-Karte mit SAK/guiformat gewährleistet die Kompatibilität mit jeder CFW auf der Switch! Ebenso ist auch eine Formatierung nach FAT32 mit Mini Tool Partition Wizard möglich, was jedoch aber installiert werden muss, und über den nachfolgenden Link bezogen werden kann:
https://mega.nz/#!eJAxXIQb!SrWVDvMwwDcScRbTv_wm4XG-MA_WiW2nqSx6bIA2_cE
Wer von exFAT nach FAT32 wechseln möchte und Probleme mit der Formatierung haben sollte, muss seine SD-Karte zunächst mit den windowseigenen Boardmitteln nach NTFS formatieren. Erst dann lässt sich die SD-Karte nach FAT32 formatieren.
Zum Prüfen der SD-Karten auf etwaige Fehler, können diese Tools verwendet werden:
Check_Flash.zip
oder
H2testw.zip